Die Kolonisation des Darmes mit Mikroorganismen erfolgt direkt nach dem Schlupf sowohl durch Aufnahme der Mikroorganismen aus der Umgebung, aber auch durch die Aufnahme von Futter und Wasser. Die frühzeitige Besiedlung des Darmes hat eine große Bedeutung für die Darmgesundheit und Produktivität der Tiere im weiteren Verlauf der Aufzucht und Mast. Zur Ausbildung eines stabilen Verdauungssystems ist es darum sehr wichtig, dass die Tiere nach der Einstallung zeitnah mit der Futter- und Wasseraufnahme beginnen.

Vor der Einstallung der Küken ist zunächst besonderer Wert auf eine korrekte Reinigung und, nach ausreichender Abtrocknung, auf die Desinfektion des Stalles zu legen. Auch die Tränkelinien müssen gereinigt und desinfiziert werden (siehe auch Kapitel Tränke).

Mit dem Aufheizen des Stalles sollte zwei Tage vor Einstallung begonnen werden. Die Raumtemperatur sollte bei der Einstallung im Tierbereich, auf Höhe der Küken, 32-36 °C betragen. Abhängig von der Jahreszeit kann die Aufheizphase dabei kürzer oder länger dauern. Im Winter kann sie gegebenenfalls auch drei Tage in Anspruch nehmen. Die Bodenplatte sollte eine Temperatur von mindestens 28 °C, besser 30 °C haben. Ist die Bodenplatte zu kalt, bildet sich Kondenswasser und die Einstreu beginnt später zu schimmeln. Entsprechend muss auch auf die relative Luftfeuchte geachtet werden. Diese sollte bei Einstallung bei 50 -70 % liegen. Nach dem Aufheizen wird die Stallfläche gleichmäßig eingestreut.

Zu hohe oder zu niedrige Stalltemperaturen wirken sich negativ auf die Gleichförmigkeit der Herde, die Sterblichkeit, die Futterverwertung und den Tageszuwachs aus. Die Körpertemperatur der Küken sollte in den ersten Tagen daher regelmäßig kontrolliert werden. Kühlen die Küken aus, fressen und trinken sie schlechter. Falls es im Winter im Stallbereich zu suboptimalen Temperaturen kommt, kann die zusätzliche Gabe von Traubenzucker über das Trinkwasser den Küken dabei helfen, nicht auszukühlen.

Die Futter- und Wasseraufnahme der Küken sollte in den ersten 48 Stunden regelmäßig über eine Beurteilung der Kropffüllung kontrolliert werden. Bei einer intensiven Tierkontrolle, ist die Kropffüllung der Tiere bereits mit bloßem Auge möglich. Durch Palpieren des Kropfes lässt sich dies absichern. Werden die Zielvorgaben nicht erreicht, hindert die Küken etwas an der Futter- und Wasseraufnahme und es müssen entsprechende Maßnahmen ergriffen werden.